Os Núcleos de Estudantes são parte integrante da Associação Académica de Coimbra e têm como função fundamental promover a ligação entre a DG/AAC e os estudantes das diferentes Faculdades e/ou Departamentos. Dependendo dos casos, os Núcleos podem representar estudantes de uma Faculdade, de um Departamento ou de uma ou várias licenciaturas. Hoje em dia, existem 26 Núcleos de Estudantes e todos os estudantes da Universidade de Coimbra são representados por um Núcleo.

Para além de promover a ligação com a DG/AAC, os Núcleos desenvolvem várias actividades específicas, para os estudantes que representam, e colaboram nas actividades promovidas pela DG/AAC nomeadamente às actividades de Política Educativa.

Há que salientar que os Núcleos de Estudantes são preponderantes no acolhimento aos novos alunos.